Wenn du 2 x 26Ah Akkus mit 12V nimmst muss du die parallel schalten, da du bei Reihenschaltung eine Ausgangsspannung von 24V erreichst.
Sonst sollte es keine Probleme mit der Parallelschaltung geben. Die 2 zusammengeschalteten Akkus verhalten sich wie ein "Großer", der ja auch nur aus einzelnen zusammengeschalteten Zellen besteht.