denke mal das problem ist folgendes...

Kommt mono aus dem Scanner und geht zum Y-stecker dieser eingang ist wohl auf beiden seiten Stereo und legt das somit jede seite auf den Linken kanal.

Problem lösen könntest du folgend durch diese änderungen.

1. einen Y-Stecker von 2x Mono auf 1x Stereo
2. Klinke Mono auf Chinch adapter, chinch kabel bis zum Y-Verteiler