Nein die können beide parallel laufen. Ist kein Problem.
Aber: wenn Du mit FMS32 Eure Alarmierungen nicht reinkriegst, was macht Dir Hoffnung dass es mit POC32 geht? OK, Poc32 ist ein wenig besser was die Auswertung angeht aber wenn bei FMS gar nichts geht seh ich da schwarz.
Darf ich mal fragen welches Signal du in den PC jagst? Wenn es aus dem Kopfhörerausgang des Scanners kommt kannste es eh vergessen! Du brauchst einen Diskriminatorausgang!
Zu den eigentlichen Einstellungen: Du musst nur unter Optionen -> POCSAG -> Eigenschaften die richtige Soundkarte auswählen. Den Rest macht POC32 standardmäßig automatisch!