Ein wenig genauer müsstest Du schon werden.

Als erstes:
Klinkekabel: Ist das Stereo oder Mono?
Scanner: Stereo oder Monoausgang?

Soundkarte:
Welcher Eingang wird genutzt?
Micro,Line In?

Aufnahmeeinstellungen angepasst?

Wenn wir das geklärt haben, können wir weiter sehen ;)