Das Problem liegt ganz einfach daran (wie bei allen externen Datenträgern), dass das Betriebssystem beim kopieren/verschieben von Dateien die Daten erst in einen Puffer schreibt und diesen dann auf die Platte leert.

Somit kann es sein wenn noch nicht alle Daten aus dem Puffer auf den externen Datenträger geschrieben worden sind, dass es zu Datenverlusten kommt wenn man die Hardware einfach so abzieht. Windows weist einen dann meistens darauf hin "dass das Gerät zur Zeit nicht entfernt werden kann". Somit sollte man immer über "Hardware sicher auswerfen" entfernen damit es eben nicht zu Datenverlusten bzw. defekten Datenträgern kommt.