Ob da Softwareseitig etwas nicht stimmt ist aus der Ferne schwer zu sagen.
Es gibt Programme wird Portmon, die etwas über den seriellen Port aussagen können. Wenn EDP nicht meckert, ist der Port zumindest nicht in dem Moment gesperrt.
Also einfach ein Voltmeter / Multimeter besorgen. Dann zwei Büroklammer in die Pins 4+5 (7+5) des COM-Ports und die Spannung zwischen diesen Büroklammer an beiden Com-Ports messen. Sofern da grosse Unterschiede sind mit dem Hersteller des SI sprechen, ob das die Ursache sein könnte. Er kann dann eine recht einfach Transistorschaltung machen, die genug Spannung für das Schalten des im SI verbauten Relais hat. Ein ähnliches Problem hatte ich auch an meinem Laptop.
Meine Schaltung am PC (12V) lief prima. Am Notebook hatte ich zu wenig Saft, um meine Relais zu schalten (ca. 5V am NB).