Steht eigentlich alles schon oben drin ;)
Aber dann hald nochmal die Antwort:

Am besten ist es, wenn du den Programmer vom Ladegerät trennbar machst.

Wenn du proggen willst, dann zieh den Stecker vom Ladegerät aus der Steckdose und dann stecke den Programmer an und progge.

Wenn du normal laden willst, dann Programmer vom Ladegerät weg und Stecker vom Ladegerät in die Steckdose.

Das wars schon :)

Ob nun der USB-Stecker drin bleibt oder nicht ist eigentlich egal weil der den Programmer nur mit Strom versorgt.