Also,
erstens mal solltest Du Dir die neueste Version von FMS32-Pro besorgen, da m.W. die Übergabe in 3.1.3 noch nicht integriert war.
Zweitens: Was gibst Du denn in Deinem Batch-File bei -subjectfile alles an? Wenn er "too many arguments" bringt deutet dies darauf hin, dass hier zu viele Parameter übergeben werden, also nicht nur der File-Name.