Das einzige was mir dazu einfallen würde wäre ein Speicherüberlauf.
Eines der eingebundenen Programme in deiner Struktur wird wohl alles schön in den RAM schreiben aber wenn er es nicht mehr braucht kicken.
Ich denke irgendein Audioprogramm welches zu den Datenstrom zukommen lässt denn der Audiostream wird immer gleich groß sein da feste Samplerate etc.

Check doch einfach mal per htop Daten der Prozesse kurz vor dem Zeitablauf.