Ich meine, dass man da gar nichts händisch anlegen mußte.
Ich hab immer nur die .jar gestartet und der Crusader hat automatisch von dem Verzeichnis aus aus dem die *.jar gestartet wurde die Unterordner und die Dateien angelegt.
Wenn es in einem Windoof-Ordner (Systemordner?) nicht geht, liegt es vermutlich an den Rechten.