das was du an befehlen brauchst findet du hier:
http://de.wikibooks.org/wiki/Batch-P..._Batch-Befehle
außerdem kannst du auf ein programm namens wait.exe zurückgreifen
http://www.petersen.de/content/conte....php?idart=163
und genau so wie felix es schreibt machst du es dann.
z.b.
Batch 1
echo Warte_20_min > c:\temp\busy.txt
c:\temp\wait.exe 20000
del c:\temp\busy.txt
Batch2
if exist c:\temp\busy.txt goto xxx