Ich denke, ich habe den Grund für dieses problem selbst gefunden, als es wieder auftrat.
Folgendes: Legt man FMS-Kennungen und Alarmscheifen über das menü im Programm an und beendet das Programm dann nicht ordnungsgemäß, also z.B. durch Systemabsturz o.Ä. werden die Kennungen nicht in die entsprechende *.cru übernommen und sind beim nächsten Start weg. So wie ich das sehe wird die *.cru erst beim richtigen Beenden des Programmes aktualisiert.